В статье приведен обзор практики рассмотрения судебных разбирательств при возмещении вреда водным объектам в результате разлива нефтепродуктов, в ходе которых, как правило, назначается судебно-экологическая экспертиза. Проанализированы положения методики исчисления размера вреда, причиненного водным объектам вследствие нарушения водного законодательства, являющиеся предметом спора между истцом и ответчиком. Рассмотрены наиболее распространенные вопросы судебно-экологической экспертизы, которые ставятся на разрешение эксперта в таких случаях.