Представлено описание микроструктуры бидисперсной феррожидкости в тонком слое, изучение которой осуществлялось с помощью комбинации компьютерного моделирования методом молекулярной динамики и аналитического построения функционала плотности свободной энергии с последующей его минимизацией. Полученные результаты позволили провести сравнительный анализ микроструктуры в квазидвумерном наносное с микроструктурой бидисперсной феррожидкости в объеме и объяснить влияние геометрии образца на формирование и распределение агрегатов из магнитных наночастиц.