Standard

Three-dimensional visualization for phylogenetic tree. / Vasev, P.; Averbukh, V.; Forghani, M.
In: Scientific Visualization, Vol. 9, No. 4, 01.01.2017, p. 59-66.

Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

Harvard

Vasev, P, Averbukh, V & Forghani, M 2017, 'Three-dimensional visualization for phylogenetic tree', Scientific Visualization, vol. 9, no. 4, pp. 59-66.

APA

Vasev, P., Averbukh, V., & Forghani, M. (2017). Three-dimensional visualization for phylogenetic tree. Scientific Visualization, 9(4), 59-66.

Vancouver

Vasev P, Averbukh V, Forghani M. Three-dimensional visualization for phylogenetic tree. Scientific Visualization. 2017 Jan 1;9(4):59-66.

Author

Vasev, P. ; Averbukh, V. ; Forghani, M. / Three-dimensional visualization for phylogenetic tree. In: Scientific Visualization. 2017 ; Vol. 9, No. 4. pp. 59-66.

BibTeX

@article{41bfa67f1ddb43ca8c855e425093f6a3,
title = "Three-dimensional visualization for phylogenetic tree",
abstract = "Филогенетические деревья используются для демонстрации эволюционной взаимосвязи между видами. Предыдущие исследования показали, что существует корреляция между мутациями и изменениями физико-химических свойств аминокислот. Рассмотрение физико-химических изменений белка дает дополнительные точки зрения на изучение процесса мутации. Система VirTree была разработана для визуализации ультраметрических филогенетических деревьев. Система создает трехмерное представление деревьев, а кроме того обеспечивает представление в среде виртуальной реальности. Система кластеризует объекты филогенетического дерева на основе физико-химических свойств аминокислоты, в то время как каждый лист имеет свою последовательность белка. Листья данного дерева также могут быть кластеризованы на основе структуры дерева и ветви, в которой они расположены. Добавление новой мерности дает возможность визуализировать каждый кластер индивидуально. Алгоритм кластеризации использует метрику на основе преобразования вейвлет-пакетов и метода классического многомерного шкалирования...",
keywords = "Physico-chemical property, Scientific visualization, Ultrametric phylogenetic tree, Viewlang, Virtual reality",
author = "P. Vasev and V. Averbukh and M. Forghani",
year = "2017",
month = jan,
day = "1",
language = "English",
volume = "9",
pages = "59--66",
journal = "Scientific Visualization",
issn = "2079-3537",
publisher = "Национальный исследовательский ядерный университет {"}МИФИ{"}",
number = "4",

}

RIS

TY - JOUR

T1 - Three-dimensional visualization for phylogenetic tree

AU - Vasev, P.

AU - Averbukh, V.

AU - Forghani, M.

PY - 2017/1/1

Y1 - 2017/1/1

N2 - Филогенетические деревья используются для демонстрации эволюционной взаимосвязи между видами. Предыдущие исследования показали, что существует корреляция между мутациями и изменениями физико-химических свойств аминокислот. Рассмотрение физико-химических изменений белка дает дополнительные точки зрения на изучение процесса мутации. Система VirTree была разработана для визуализации ультраметрических филогенетических деревьев. Система создает трехмерное представление деревьев, а кроме того обеспечивает представление в среде виртуальной реальности. Система кластеризует объекты филогенетического дерева на основе физико-химических свойств аминокислоты, в то время как каждый лист имеет свою последовательность белка. Листья данного дерева также могут быть кластеризованы на основе структуры дерева и ветви, в которой они расположены. Добавление новой мерности дает возможность визуализировать каждый кластер индивидуально. Алгоритм кластеризации использует метрику на основе преобразования вейвлет-пакетов и метода классического многомерного шкалирования...

AB - Филогенетические деревья используются для демонстрации эволюционной взаимосвязи между видами. Предыдущие исследования показали, что существует корреляция между мутациями и изменениями физико-химических свойств аминокислот. Рассмотрение физико-химических изменений белка дает дополнительные точки зрения на изучение процесса мутации. Система VirTree была разработана для визуализации ультраметрических филогенетических деревьев. Система создает трехмерное представление деревьев, а кроме того обеспечивает представление в среде виртуальной реальности. Система кластеризует объекты филогенетического дерева на основе физико-химических свойств аминокислоты, в то время как каждый лист имеет свою последовательность белка. Листья данного дерева также могут быть кластеризованы на основе структуры дерева и ветви, в которой они расположены. Добавление новой мерности дает возможность визуализировать каждый кластер индивидуально. Алгоритм кластеризации использует метрику на основе преобразования вейвлет-пакетов и метода классического многомерного шкалирования...

KW - Physico-chemical property

KW - Scientific visualization

KW - Ultrametric phylogenetic tree

KW - Viewlang

KW - Virtual reality

UR - http://www.scopus.com/inward/record.url?scp=85037078351&partnerID=8YFLogxK

UR - http://elibrary.ru/item.asp?id=36685879

M3 - Article

AN - SCOPUS:85037078351

VL - 9

SP - 59

EP - 66

JO - Scientific Visualization

JF - Scientific Visualization

SN - 2079-3537

IS - 4

ER -

ID: 6208551