Филогенетические деревья используются для демонстрации эволюционной взаимосвязи между видами. Предыдущие исследования показали, что существует корреляция между мутациями и изменениями физико-химических свойств аминокислот. Рассмотрение физико-химических изменений белка дает дополнительные точки зрения на изучение процесса мутации. Система VirTree была разработана для визуализации ультраметрических филогенетических деревьев. Система создает трехмерное представление деревьев, а кроме того обеспечивает представление в среде виртуальной реальности. Система кластеризует объекты филогенетического дерева на основе физико-химических свойств аминокислоты, в то время как каждый лист имеет свою последовательность белка. Листья данного дерева также могут быть кластеризованы на основе структуры дерева и ветви, в которой они расположены. Добавление новой мерности дает возможность визуализировать каждый кластер индивидуально. Алгоритм кластеризации использует метрику на основе преобразования вейвлет-пакетов и метода классического многомерного шкалирования...
Translated title of the contributionТРЕХМЕРНАЯ ВИЗУАЛИЗАЦИЯ ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИХ ДЕРЕВЬЕВ
Original languageEnglish
Pages (from-to)59-66
Number of pages8
JournalScientific Visualization
Volume9
Issue number4
Publication statusPublished - 1 Jan 2017

    Level of Research Output

  • VAK List

    ASJC Scopus subject areas

  • Software
  • Computer Vision and Pattern Recognition

    GRNTI

  • 50.00.00 AUTOMATION. COMPUTER ENGINEERING

    Research areas

  • Physico-chemical property, Scientific visualization, Ultrametric phylogenetic tree, Viewlang, Virtual reality

ID: 6208551