Статья посвящена разработке методологического подхода к согласованию приоритетов научно-технологического и пространственного развития регионов. Актуальность исследования обусловлена значимостью выбора ориентиров трансформации региональных хозяйственных систем, основанных на принципах гармонизации социально-экономических интересов личности, субъектов хозяйствования, территорий разного уровня и современных перспектив развития науки и технологий. Цель работы обоснование методологии оценки и отбора приоритетов согласованного научно-технологического и пространственного развития экономики индустриально развитых регионов, в основе которой лежит сочетание интересов отдельных территорий при их совместном участии в комплексных инвестиционных проектах межрегионального значения. В исследовании применены общенаучные методы теоретического и эмпирического познания: причинно-следственный метод, метод анализа и синтеза, метод научной абстракции. В статье обоснована роль макрорегионов в процессе интеграции инициатив локальных территорий с национальными ориентирами развития, определены признаки комплексных инвестиционных проектов, имеющих значительный потенциал, на основе которых могут быть определены критерии оценки и отбора проектов и проектных инициатив, предлагаемых для реализации на надрегиональном уровне. Предложен алгоритм разработки комплексного инвестиционного проекта, определяющий последовательность мероприятий, которые позволяют реализовать имеющиеся у индустриально развитых регионов возможности научно-технологического развития с учетом приоритетов их пространственных преобразований, произведена его апробация на примере индустриального Уральско-Сибирского макрорегиона (обозначены ключевые аспекты пилотного проекта «Уральская магистраль»). Особенностью разработанного подхода является предложение двухполюсной системы определения приоритетов, позволяющей интегрировать национальные ориентиры научно-технологического и пространственного развития с перспективами преобразований, определяемыми отдельными территориями индустриально развитыми регионами. Предложенный подход может найти применение при обосновании предложений и мер стратегического характера, направленных на реализацию приоритетов пространственного развития и развития научно-технологического комплекса индустриально развитых регионов.